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Il Gruppo di ricerca di Biologia Teorica e Bioinformatica si occupa dello studio delle relazioni tra la struttura e la funzione delle proteine attraverso tecniche di bioinformatica e chimica computazionale.
Le principali linee di ricerca attive sono:
- Studio della specificità di substrato e del meccanismo di trasporto di trasportatori mitocondriali della famiglia SLC25;
- Studio dei sistemi proteici coinvolti nell’omeostasi del ferro nell’uomo con particolare riferimento al trasporto attraverso la membrana plasmatica e mitocondriale;
- Sviluppo di anticorpi terapeutici diretti contro bersagli molecolari tumorali.
Tali linee di ricerca sono state o sono tuttora finanziate dalla Comunità Europea (Programma FP7, Azioni COST, Azioni Marie Curie), dal CASPUR e dal CINECA (Progetti HPC e ISCRA), dal MIUR (Progetti PRIN e Dipartimenti di Eccellenza) e dall’Istituto Nazionale Biostrutture e Biosistemi.
Highlights
1: Quadrotta V, Polticelli F. Modeling the different conformations of the human mitochondrial ADP/ATP carrier using AlphaFold and molecular dynamics simulations of the protein-ligand complexes. Comput Struct Biotechnol J. 2025; 27: 1265-1277. doi: Link identifier #identifier__143782-210.1016/j.csbj.2025.03.036.
2: Amadei M, Polticelli F, Musci G, Bonaccorsi di Patti MC. The Ferroxidase-Permease System for Transport of Iron Across Membranes: From Yeast to Humans. Int J Mol Sci. 2025; 26: 875. doi: Link identifier #identifier__102948-310.3390/ijms26030875.
3: Pasquadibisceglie A, Quadrotta V, Polticelli F. In Silico Analysis of the Structural Dynamics and Substrate Recognition Determinants of the Human Mitochondrial Carnitine/Acylcarnitine SLC25A20 Transporter. Int J Mol Sci. 2023; 24: 3946. doi: Link identifier #identifier__95154-410.3390/ijms24043946.
4: Pasquadibisceglie A, Leccese A, Polticelli F. A computational study of the structure and function of human Zrt and Irt-like proteins metal transporters: An elevator-type transport mechanism predicted by AlphaFold2. Front Chem. 2022; 10: 1004815. doi: Link identifier #identifier__96456-510.3389/fchem.2022.1004815.
6: Pasquadibisceglie A, Polticelli F. Structural determinants of ligands recognition by the human mitochondrial basic amino acids transporter SLC25A29. Insights from molecular dynamics simulations of the c-state. Comput Struct Biotechnol J. 2021; 19: 5600-5612. doi: Link identifier #identifier__174977-610.1016/j.csbj.2021.10.007.
Membri
- Prof. Link identifier #identifier__102266-7Fabio Polticelli (Responsabile del laboratorio) Pubblicazioni Link identifier #identifier__118583-9ORCID iD
- Dott. Alfredo De Lauro (Borsista Postdottorato) Pubblicazioni Link identifier #identifier__149764-11ORCID iD
- Dott.ssa Beatrice Gasperini (Assegnista di Ricerca) Pubblicazioni Link identifier #identifier__150288-12ORCID iD
- Dott.ssa Link identifier #identifier__6906-13Virginia Quadrotta (Dottoranda di Ricerca) Pubblicazioni Link identifier #identifier__31881-15ORCID iD
- Dott. Link identifier #identifier__123353-16Sergio Vulterini (Dottorando di Ricerca) Pubblicazioni Link identifier #identifier__154464-17ORCID iD
- Prof. Link identifier #identifier__82473-18Daniele Toti (Collaboratore Esterno) Link identifier #identifier__68984-19Pubblicazioni Link identifier #identifier__178959-20ORCID iD
Collaborazioni
- Università degli Studi di Roma “La Sapienza”
- Università di Bari
- Università del Molise
- Università Cattolica di Brescia
- Oslo University Hospital (Norvegia)
- Ulm University (Germania)
- Universidad de la Republica (Uruguay)