Biologia teorica e Bioinformatica

immagine della linea di ricerca di biochimica e bioinformaticaIl Gruppo di ricerca di Biologia Teorica e Bioinformatica si occupa dello studio delle relazioni tra la struttura e la funzione delle proteine attraverso tecniche di bioinformatica e chimica computazionale. Le principali linee di ricerca attive sono:

Tali linee di ricerca sono state o sono tuttora finanziate dalla Comunità Europea (Programma FP7, Azioni Marie Curie), dal CASPUR e dal CINECA (Progetti HPC e ISCRA) e dal MIUR (Progetti PRIN e Dipartimenti di Eccellenza).

Highlight

  • Macari et al. Fragment-Based Ligand-Protein Contact Statistics: Application to Docking Simulations. Int J Mol Sci. 2019;20(10): E2499.
  • Toti et al. LIBRA-WA: a web application for ligand binding site detection and protein function recognition. Bioinformatics. 2018;34(5):878-880.
  • Brandi et al. A comprehensive in silico analysis of huntingtin and its interactome. J Biomol Struct Dyn. 2018;36(12):3155-3171.
  • Di Muzio et al. DockingApp: a user friendly interface for facilitated docking simulations with AutoDock Vina. J Comput Aided Mol Des. 2017;31(2):213-218.

Membri

  • Prof. Fabio Polticelli
  • Dott.ssa Valentina Brandi (Assegnista di Ricerca)
  • Dott.ssa Valentina Tortosa (Assegnista di Ricerca)
  • Dott. Gabriele Macari (Dottorando)
  • Dott. Andrea Pasquadibisceglie (Dottorando)
  • Dott. Ing. Daniele Toti (Collaboratore Esterno)

Collaborazioni

  • Università degli Studi di Roma “La Sapienza”
  • Università degli Studi di Roma “Tor Vergata”
  • Università del Molise
  • Ospedale Pediatrico Bambino Gesù
  • Vrije Universiteit Amsterdam (Olanda)
  • Universitè Clermont Auvergne (Francia)
  • Universidad de la Republica (Uruguay)
  • Centro de Investigación Cooperativa en Biomateriales biomaGUNE (Spagna)
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admin 26 Agosto 2020